Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00477Q96M19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00477Q96M19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms