Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM47Q96LD4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms