Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPZA3Q96KX2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPZA3Q96KX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms