Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJD4Q96KN9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJD4Q96KN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GJD4Q96KN9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms