Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKNOX2Q96KN3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKNOX2Q96KN3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms