Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDLIM2Q96JY6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDLIM2Q96JY6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms