Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SERAC1Q96JX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERAC1Q96JX3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms