Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC34Q96HJ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms