Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ASIC4Q96FT7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ASIC4Q96FT7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms