Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC97Q96F63 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC97Q96F63 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms