Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM12Q96EX1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM12Q96EX1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms