Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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