Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL53Q96EL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms