Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CMTM5Q96DZ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms