Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C18orf8Q96DM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms