Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC39Q96DD0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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