Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RMDN1Q96DB5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN1Q96DB5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms