Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms