Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL29Q96CT2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL29Q96CT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms