Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYTL4Q96C24 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYTL4Q96C24 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms