Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHD2Q96C19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFHD2Q96C19 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms