Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VOPP1Q96AW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms