Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYAP1Q96A49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYAP1Q96A49 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms