Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJA10Q969M2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJA10Q969M2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms