Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.14
PRG4Q92954 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRG4Q92954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRG4Q92954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms