Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
EDEM1Q92611 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDEM1Q92611 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms