Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC12Q8WVT3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms