Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRUNE2Q8WUY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRUNE2Q8WUY3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms