Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF6Q8TEU7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF6Q8TEU7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF6Q8TEU7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
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