Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF398Q8TD17 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF398Q8TD17 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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