Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3IL1Q8TBN0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB3IL1Q8TBN0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms