Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBA3Q8TBC4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA3Q8TBC4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA3Q8TBC4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms