Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHDC4Q8TBB5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms