Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGA8

OR4F17, Olfactory receptor 4F17, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR4F17Q8NGA8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OR4F17Q8NGA8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms