Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL22A1Q8NFW1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms