Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC197Q8NCU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms