Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00301Q8NCQ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00301Q8NCQ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00301Q8NCQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms