Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FSIP1Q8NA03 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FSIP1Q8NA03 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms