Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDCL2Q8N4E4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDCL2Q8N4E4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms