Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCML4Q8N228 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML4Q8N228 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms