Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJD3Q8N144 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJD3Q8N144 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms