Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLFN12Q8IYM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLFN12Q8IYM2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLFN12Q8IYM2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms