Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP4Q86YS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP4Q86YS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms