Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RD3Q7Z3Z2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms