Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms