Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms