Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG9AQ7Z3C6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG9AQ7Z3C6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG9AQ7Z3C6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG9AQ7Z3C6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG9AQ7Z3C6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG9AQ7Z3C6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms