Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARCQ7LC44 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCQ7LC44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms