Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SV2BQ7L1I2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SV2BQ7L1I2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SV2BQ7L1I2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms