Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BRINP3Q76B58 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BRINP3Q76B58 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms